陽明校區牙醫學系成立於民國六十五年，為六年學制，招收自費學生。並於八十一年、八十二年、一一0年分別成立臨床牙醫學研究所、口腔生物研究所與口腔組織工程與生計材料研究所。八十三年成立牙醫學院籌備處，八十九年奉准成立牙醫學院，得使牙醫教育更趨健全。創系四十多年來，秉著兼顧基礎學理與臨床訓練的原則，培養具獨立思考及研究精神的時代青年。目前共有一千六百餘名畢業生，多數從事臨床醫療工作─以仁心仁術照顧國民的口腔保健；亦有部分校友繼續深造，取得歐美先進國家之著名大學的博士學位，投入尖端牙醫生物及材料科學的研究工作。陽明交通牙醫之畢業生於國家考試，高考及公費留考屢創佳績，每一位校友的醫德及高超醫術素養不愧陽明之嚴謹訓練。
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